Eclipse es la caña, pero sobrecargarlo de pligins no es bueno. En mi caso tengo Aptana, php-Codesniffer, phpUnit, subeclipse, googleApi y un largo etc… por lo que llego un momento al importar un proyecto en el que al inspeccionar el codigo eclipse se cerraba con un error.

Basicamente me cargaba toda la memoria de la maquina virtual de Java y toso se marchava a tomar viento.

El workarround es darle mas memoria, para eso se arranca eclipse con los siguientes parametros: -vmargs -Xmx512M -XX:PermSize=64M -XX:MaxPermSize=128M

Lo ideal es añadirlo a la llamada del lanzador o el acceso directo si usas Ms Win.